本剧以群雄盘踞的东汉末年为背景，讲述医圣张仲景历经坎坷，逐渐从一心复仇的懵懂少年成长为济世神医的故事。

        东汉末年，政局动荡，宦官当政，正值天下瘟疫频发，民不聊生。民间邪教无量教趁机与朝官暗中勾结，以赈灾救世之名，兜售含有大麻的神符散发国难财。张仲景父亲张宗汉时为朝廷命官，他识破邪教恶行，势要剿灭无量教，不想却反遭诬陷，引来杀身之祸，致使张仲景一族满门抄斩，为保忠良之后，神医张伯祖将张子良救走至悬濟堂，收为弟子，从此张仲景隐姓埋名寄居在悬濟堂。

        张仲景因家族仇恨跌落谷底，一心想要下山去找无量教教主高量报仇。张伯祖为了保住张仲景，与他立下约定，只要他将悬濟堂所有药典抄录一遍方可下山，不想张仲景天资聪颖，有过目不忘的本事，用了四年时间抄完所有药典，并牢记在心，为日后行医救人打下坚实基础。完成与师父的约定，张仲景不忘深仇，偷偷下山潜进无量教复仇，张伯祖情急之下派大师兄周亢前去搭救，没想到两人竟阴差阳错救了仇人高量的女儿高嫖姚，由此更展开了一段错位的畸恋。

        张仲景与周亢救人后趁慌乱逃出无量教，却被无量教徒追杀，面临绝境时被路过的赵巨、赵凌烟兄妹所救，为此赵巨身受重伤，差点丢掉性命，通过对这次复仇所带来的后果进行反思，张仲景决定放下仇恨跟张伯祖潜心学医。